色谱法的应用可以根据目的分为制备性色谱和分析性色谱两大类。制备性色谱的目的是分离混合物，获得一定数量的纯净组分，这包括对有机合成产物的纯化、天然产物的分离纯化以及去离子水的制备等。相对于色谱法出现之前的纯化分离技术如重结晶，色谱法能够在一步操作之内完成对混合物的分离，但是色谱法分离纯化的产量有限，只适合于实验室应用。制备色谱到底是什么?(1)分析色谱的目的，是分析出混合物中一个(或者几个)纯物质的含量。制备色谱的目的，是从混合物中得到纯物质。为了加快分离的时间与提高分离的效率，制备色谱的的进样品量很大，导致制备色谱柱子的分离负荷的相应加大，也就必须加大色谱柱填料，增大制备色谱的直径和长度，使用的相对多的流动相。然而，当色谱柱上样品负载加大的时候，往往导致柱效急剧下降而得不到纯的产品。制备色谱，要解决容量与柱子效果之间的矛盾，对重现性也要考虑。从经济上来说。进样系统液相色谱仪当测量样品的面积，峰高数据不重复时，则要考虑进样系统的问题。制备色谱要争取少用填料，少用溶剂，要尽可能多的得到产品。(2)样品的前处理：制备色谱柱子由于处理的样品多，比分析柱子更容易受污染，所以，-的前处理就显得非常的-。萃取、过滤、结晶、固相萃取等简单的分离方法，如果用得上，而且还不是很麻烦，就要尽可能多的采用以去掉杂质。(3)固定相的选择硅胶、键合固定相(如c18)、离子交换树脂、聚-、氧化铝、凝胶等都可以作为色谱柱的填料。 有不少文献-，对填料可以进行一下处理提高了分离效果，如，对硅胶进行的(或缓冲液)处理。
塞杆 现象：液相色谱仪无流动相流出，压力波动，更换新的垫圈后仍渗漏。原因：一旦出现以上现象，只有更换柱塞杆。更换进要用-工具，由于此项操作比较复杂困难，故需请维修-来解决。也可自行按说明书的指导仔细进行。
进样系统 液相色谱仪当测量样品的面积，峰高数据不重复时，则要考虑进样系统的问题。手动进样器 首先检查手动进样器是否有渗漏，一般是由于污染使转子磨损或用尖头的针扎进手动进样器，划伤了转子。因此在定期清洗进样器，使用缓冲液后，要用水进行充分的冲洗，以防沉积结晶盐，磨损转子。如确定转子已磨损，则要更换转子。若有进样器管路部分阻塞，可分段检查，将阻塞的管路拆下，反装在泵出口处进行反冲。 自动进样品 a、针密封垫损坏。此时出现渗漏。解决的办法是将自动进样器顺序设定在维修位置。色谱柱是进行色谱分析的主要仪器，色谱柱的正确安装才能-发挥其的性能和延长使用寿命。取下密封垫，更换一新的后将针复位。b、针污染。取下针，放在内进行超声清洗，或更换新针。c、定量环污染。取下定量环反装在泵的出口，以为流动相用大流速进行反冲。也可更换新的定量环。
液相色谱仪的常规操作及维修： 1、过滤流动相，根据需要选择不同的滤膜。 2、对抽滤后的流动相进行超声脱气10-20分钟。 3、打开hplc工作站，连接好流动相管道，连接检测系统。 4、进入hplc控制界面主菜单，-manual，进入手动菜单。 5、有一段时间没用，或者换了新的流动相，需要先冲洗泵和进样阀。冲洗泵，直接在泵的出水口，用针头抽取。冲洗进样阀，需要在manual菜单下，先-purge，再-start，冲洗时速度不要超过10ml/min。 6、调节流量，初次使用新的流动相，可以先试一下压力，流速越大，压力越大，一般不要超过2000。-injure，选用合适的流速，-on，走基线，观察基线的情况。 7、设计走样方法。-file，选取se-lectusersandmethods，可以选有的各种走样方法。若需建立一个新的方法，-newmethod。选取需要的配件，包括进样阀，泵，检测器等，根据需要而不同。选完后，-protocol。初始阶段基线应持续上升，在到达老化温度后5-10分钟开始下降，并且会持续30-90分钟。一个完整的走样方法需要包括：a、进样前的稳流，一般2-5分钟；b、基线归零；c、进样阀的loading-inject转换；d、走样时间，随不同的样品而不同。 8、进样和进样后操作。选定走样方法，-start。进样，所有的样品均需过滤。方法走完后，-trun，可记录数据和做标记等。全部样品走完后，再用上面的方法走一段基线，洗掉剩余物。 9、关机时，先关计算机，再关液相色谱。
色谱法分类
按两相的物理状态可分为：气相色谱法(gc)和液相色谱法(lc)。气相色谱法适用于分离挥发性化合物。gc根据固定相不同又可分为气固色谱法(gsc)和气液色谱法(glc)，其中以glc应用广。液相色谱法适用于分离低挥发性或非挥发性、热稳定性差的物质。下面就这两分别展开讨论流动相以甲1醇为例，色谱柱以c18为例。lc同样可分为液固色谱法(lsc)和液液色谱法(llc)。此外还有超临界流体色谱法(sfc)，它以超临界流体(界于气体和液体之间的一种物相)为流动相(常用co2)，因其扩散系数大，能很快达到平衡，故分析时间短，-适用于手性化合物的拆分。
按原理分为吸附色谱法(ac)、分配色谱法(dc)、离子交换色谱法(iec)、排阻色谱法(ec，又称分子筛、凝胶过滤(gfc)、凝胶渗透色谱法(gpc)和亲和色谱法。(此外还有电泳。)
按操作形式可分为纸色谱法(pc)、薄层色谱法(tlc)、柱色谱法。
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